技術(shù)文章
Technical articles美國Prospect Biosystems, Inc.公司發(fā)明的Edge?200氣動密度超速分離系統(tǒng), 是一種易于操作、壓縮空氣驅(qū)動的臺式超離系統(tǒng),可實現(xiàn)強化密度離心分離。突破性的Edge技術(shù)采用的是分步密度梯度分離的方式,其分離溶液的濃度逐步增加, 提供了一個快速的,以生物學(xué)的變化為基本的,簡化組織和細(xì)胞復(fù)雜成分的分離分組新方法。從而為生物標(biāo)志物研發(fā),臨床診斷,及外科病理學(xué)提供了一個有力的工具和技術(shù)平臺。
Edge技術(shù)在不同生物學(xué)分析流程中的應(yīng)用
與其它蛋白分析技術(shù)相配合
應(yīng)用領(lǐng)域
1.低豐度蛋白的分離和富集
◆Edge 技術(shù)能夠保持被分離組織或細(xì)胞亞結(jié)構(gòu)分區(qū)的完整性
◆降低原樣品中成分的復(fù)雜性獲得樣品的濃縮和富集,大幅度增加在下游2-D膠上被檢測到的機率
◆加快靶蛋白濃度的鑒定速度,推進靶蛋白與亞細(xì)胞分區(qū)相互關(guān)系的研究
應(yīng)用范例:分離分組大鼠肝臟的去細(xì)胞核勻漿上清液
2.尋找和發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)記物
◆Edge 技術(shù)和 Edge200 分離系統(tǒng)與其它傳統(tǒng)蛋白分析技術(shù),如蛋白轉(zhuǎn)印, 2D膠電泳和質(zhì)譜相結(jié)合, 提供了一個快速有效的鑒定通路生物標(biāo)志物及相關(guān)變化的生物網(wǎng)路系統(tǒng)。
◆Edge 技術(shù)融合了該公司的評估潛在生物標(biāo)記物的統(tǒng)計算法,該技術(shù) (受保護)基于生物標(biāo)記物的相對百分比分布,為進一步的臨床驗證提供更多的數(shù)據(jù)和機會。
應(yīng)用范例:內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激反應(yīng)和糖尿病關(guān)系的研究中,在分組樣品中用已知生物途徑標(biāo)志物如IRE1為探針,有可能同時發(fā)現(xiàn)新的與該途徑相關(guān)的其他生物標(biāo)志物。
3.不同的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)分區(qū)內(nèi)生物信息和其變化的研究
應(yīng)用范例:Edge 200可以用來研究在誘導(dǎo)I型糖尿病時T 細(xì)胞改變過程中,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)分子伴侶蛋白和其他熱休克蛋白家族成員的作用。
4.生物標(biāo)志物的評價和驗證
◆Edge 技術(shù)融合了Prospect公司的評估潛在生物標(biāo)記物的統(tǒng)計算法,該技術(shù)(受保護)基于生物標(biāo)記物的相對百分比分布,為進一步的臨床驗證提供更多的數(shù)據(jù)和機會。
應(yīng)用范例:突觸功能障礙標(biāo)記物p-synapsinI和氧化應(yīng)激標(biāo)記物GRP75作標(biāo)記物在大鼠大腦和心臟中的表達(dá)對比研究
5.營養(yǎng)蛋白組學(xué)
應(yīng)用范例:葉酸缺乏和氧化應(yīng)激
◆Edge 技術(shù)與2D LC-MS/MS技術(shù)相結(jié)合可以用于葉酸缺乏和正常組大鼠肝臟之間低豐度生物標(biāo)志蛋白的定量分析比較。這項綜合技術(shù)既快速又可承擔(dān)大樣品量的分析任務(wù)。
◆Edge 密度萃取法與其它傳統(tǒng)的蛋白譜分析技術(shù),蛋白轉(zhuǎn)印,2D電泳和質(zhì)譜相結(jié)合提供了一個快速的蛋白組學(xué)究方法,從而可以充分理解葉酸缺乏同時對大鼠大腦和肝臟的影響以及相應(yīng)亞細(xì)胞水平上蛋白變化之間的生物學(xué)。
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